Международная группа исследователей обнаружила 54 945 последовательностей РНК-вирусов в образцах, собранных в 102 городах и прилегающих районах 31 страны. Около 77% этих последовательностей ранее не встречались в научных базах данных. Результаты опубликованы в журнале Nature Communications.
Ученые изучили 2922 образца, собранных в 2020 году и полученных из открытых генетических баз данных. Среди них были пробы с городских поверхностей, включая поручни и билетные автоматы, а также образцы почвы, пресной воды, осадков и сточных вод.
В отличие от исследований, направленных на поиск конкретных возбудителей, в этой работе специалисты анализировали генетический материал из каждого образца. С помощью компьютерных алгоритмов они выявляли последовательности, относящиеся к вирусам. Из общего числа обнаруженных вариантов 12 487, или около 23%, совпали с уже известными последовательностями.
При этом новые находки пока нельзя считать десятками тысяч подтвержденных ранее неизвестных видов вирусов. Исследователи обнаружили генетические последовательности, но не выделили сами вирусы. Для многих находок еще предстоит установить, какие организмы они способны заражать и могут ли они представлять опасность для человека.
По предварительным оценкам ученых, значительная часть обнаруженных вирусов относится к бактериофагам — вирусам, которые заражают бактерии. Особый интерес представляют 166 выявленных бактериофагов, связанных с четырьмя видами бактерий, устойчивых к лекарственным препаратам и вызывающих внутрибольничные инфекции. Эти результаты могут быть полезны для дальнейших исследований фаготерапии — метода борьбы с бактериями с помощью вирусов.
Разнообразие вирусных последовательностей различалось в зависимости от типа образца. В почве и осадках их оказалось больше, чем на поверхностях в оживленных городских местах. Особенно разнообразные последовательности обнаружили в сточных водах, что указывает на перспективность их изучения для мониторинга микроорганизмов в городской среде.